CrRNA trans-attivatore
In biologia molecolare, il crRNA trans-attivatore (tracrRNA) è un piccolo RNA con un ruolo importante all'interno del sistema difensivo CRISPR/Cas; è, tuttavia, codificato da un gene esterno al locus CRISPR. È stato scoperto per la prima volta nel patogeno Streptococcus pyogenes.[1] Nei batteri e archea; CRISPR/Cas (acronimo dall'inglese Clustered, Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats/CRISPR-associated proteins) costituisce un sistema difensivo che li protegge da invasioni virali o da plasmidi potenzialmente dannosi. Questo sistema difensivo è costituito fondamentalmente da tre fasi.
Innanzitutto una copia del DNA invasore (fagico o plasmidico) è integrato all'interno del locus CRISPR. Dopodiché, esso viene trascritto producendo il cosiddetto pre-crRNA (CRISPR RNA non maturo). Infine, l'RNA viene reclutato da Cas9 formando un complesso attivo.
Vi sono numerose vie attraverso cui questo RNA può essere attivato; una delle meglio conosciute richiede la trans-attività del tracrRNA, il quale è in grado di complementarsi parzialmente con il pre-crRNA formando un ibrido di RNA a doppio filamento. Tale ibrido non maturo è soggetto a tagli ribonucleasici mediati dalla RNasi III, una ribonucleasi RNA specifica, che genera il duplex maturo denominato ibrido crRNA/tracrRNA. Questo RNA è incorporato in un complesso effettore con la proteina endonucleasica Cas9, dove funge da RNA guida per il riconoscimento di acido nucleico estraneo, in seguito degradato da Cas9.[1][2][3][4]
Note
modifica- ^ a b Deltcheva E, Chylinski K, Sharma CM, Gonzales K, Chao Y, Pirzada ZA, et al., CRISPR RNA maturation by trans-encoded small RNA and host factor RNase III., in Nature, vol. 471, n. 7340, 2011, pp. 602–7, DOI:10.1038/nature09886, PMC 3070239, PMID 21455174.
- ^ Terns MP, Terns RM, CRISPR-based adaptive immune systems., in Curr Opin Microbiol, vol. 14, n. 3, 2011, pp. 321–7, DOI:10.1016/j.mib.2011.03.005, PMC 3119747, PMID 21531607.
- ^ Jinek M, Chylinski K, Fonfara I, Hauer M, Doudna JA, Charpentier E, A Programmable Dual-RNA-Guided DNA Endonuclease in Adaptive Bacterial Immunity., in Science, vol. 337, n. 6096, 2012, pp. 816–21, DOI:10.1126/science.1225829, PMC 6286148, PMID 22745249.
- ^ Brouns SJ, A swiss army knife of immunity., in Science, vol. 337, n. 6096, 2012, pp. 808–9, DOI:10.1126/science.1227253, PMID 22904002.
